Séminaires Bioinformatique

Lieu des séminaires :

INRIA Rennes - Bretagne - Atlantique

Demie journée Thématique: Modélisation

• Denis Thieffry (Faculté des Sciences de Luminy (Aix-Marseille), département de biologie computationnelle, TAGC.)

  Diversity and plasticity of Th cell types predicted from regulatory network modelling

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• Mathieu Piel (Institut Curie, Unité Compartimentation et dynamique cellulaires, Equipe Biologie cellulaire systémique de la polarité et de la division)

  Simple micro-tools to study complex cell behaviors : from yeast morphogenesis to dendritic cell migration and orientation of the mitotic spindle in mammalian cells

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• Damien Eveillard (Université de Nantes, Computational Biology group, LINA - UMR CNRS 6241)

  Modeling biological systems: bridging the gap between formalisms and biological contexts.

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programme pdf

(Abstract-25mars2010.pdf - 190.31 Ko)

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Infos complètes

Journées Thématiques Bioinformatique

Dans le cadre de l'animation de Ouest-Genopole, le projet de binformatique (Symbiose) de l'Irisa organise des journées thématiques à destination des biologistes et informaticiens du Grand-Ouest.

Séminaire de Colin de la Higuera (LINA, Nantes) - 5 Mars - salle Oléron

• Colin de la Higuera

  Probabilistic Automata

Transparents

(stochastic_automata.pdf - 369.57 Ko)

Séminaire de Thomas Lavergne (LIMSI/CNRS)

• Thomas Lavergne

  À propos des CRFs.

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Séminaire du projet Symbiose

Séminaire de bioinformatique de l'Irisa. Le public est constitué du projet symbiose et de différents membres de l'Irisa.

Lieu des séminaires :

INRIA Rennes - Bretagne - Atlantique

Séminaire d'Inken Wohlers (Centrum Wiskunde & Informatica, Amsterdam) - 14 Janvier - salle Aurigny

• Inken Wohlers

  Aligning Protein Structures Using Distance Matrices and Combinatorial Optimization

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Séminaire de Gunnar Klau (CWI, Amsterdam) - 28 Janvier - salle Aurigny

• Gunnar Klau

  An exact algorithm to detect functional modules in protein-protein interaction networks

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Mathilde Carpentier (Université Paris 6 (UPMC))

• Mathilde Carpentier

  Titre en attente

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Florian Sikora (Université de Marne-la-Vallée)

• Florian Sikora

  La recherche de motifs dans les réseaux d'interactions

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Séminaire de Daniel Porumbel (Université d'Anger) - 11 Février - salle Sardaigne

• Daniel Porumbel

  Position-guided diversification and intensification for graph coloring local search

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Deux stratégies d'assignation de fitness pour les Algorithmes Génétiques Multi-Objectifs

• Wilmer Pereira (délégation LIP6, Paris)

  Deux stratégies d'assignation de fitness pour les Algorithmes Génétiques Multi-Objectifs

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Séminaire de Todd Treangen (UMPC - Atelier de Bioinformatique) - 1 Avril - Salle Aurigny

• Todd Treangen

  On the detection and abundance of large repeats in prokaryote genomes

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Séminaire d'Andrés Ritter (UPMC Univ. Paris 06, Station Biologique de Roscoff) - 29 Avril - salle Aurigny

• Andrés Ritter

  From the Ectocarpus genome to its proteome and back

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Séminaire de Michel Masella (Direction des Sciences du Vivant, CEA/DSV/iBiTEC-S/SIMOPRO/LCV, Gif-sur-Yvette)

• Michel Masella (Direction des Sciences du Vivant, CEA/DSV/iBiTEC-S/SIMOPRO/LCV, Gif-sur-Yvette)

  An accurate and efficient computational approach to investigate proteinic systems in aqueous solution at the atomic scale.

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Séminaire de Mirjam Czjzek (UPMC Univ. Paris 06, Station Biologique de Roscoff)

• Mirjam Czjzek (UPMC Univ. Paris 06, Station Biologique de Roscoff)

  Du gène à la fonction en glycobiologie marine: la chasse au trésor dans le génome de la flavobactérie marine Zobellia galactanivorans

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Séminaire d'AlexisDufresne (UMR 6553 Ecobio université Rennes 1 et CNRS)

• Alexis Dufresne, Equipe « Rôle de la Biodiversité dans les Processus Ecologiques »; UMR 6553 « Ecosystèmes, Biodiversité - Evolution », CNRS/ Université de Rennes 1; Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes.

  Du génome à l'écosystème : intégrer la génomique environnementale avec l'écologie fonctionnelle

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Séminaire de Fabio Cunial (College of Computing, Georgia Institute of Technology, Atlanta, USA)

• Fabio Cunial

  The subsequence composition of polypeptides

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slides

(cunial.pdf - 3.68 Mo)

Séminaire de Jérémy Just (INRA Le Rheu et Evry)

• Jérémy Just

  Brassica genome sequencing: understanding the consequences of recurrent polyploidizations on genome organization and evolution

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Séminaire d'Alejandro Maass (UCHILE-CNRS Faculty of Physical and Mathematical Sciences University of Chile )

Bioinformatic project arround copper biolixiviation

• Alejandro Maass

  Bioinformatic project arround copper biolixiviation

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Liens

Alejendro Maass

Autres manifestations

Diverses manifestations portant sur la bioinformatique à Rennes et aux alentours

Soutenance de thèse de Carito Guziolowski-Vargas (EPI Symbiose, INRIA Rennes) 8 Janvier - salle Métivier

• Carito Guziolowski-Vargas

  Analysis of Large-Scale Biological Networks with Constraint-Based Approaches over Static Models

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Soutenance de thèse de Noel Malod-Dognin (EPI Symbiose, INRIA Rennes) 29 Janvier - salle Métivier

• Noel Malod-Dognin

  Protein Structure Comparison: From Contact Map Overlap Maximisation to Distance-based Alignment Search Tool.

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Soutenance de thèse de Pierre Blavy (EPI Symbiose, INRIA Rennes) 12 Mars, Agrocampus

• Pierre Blavy

  Identification des éléments clefs du métabolisme des lipides et de leurs régulateurs

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accès agrocampus

Soutenance de thèse de Guillaume Collet - Jeudi 8 juillet, 10h30, Amphi A, bâtiment 2

• Guillaume Collet (EPI Symbiose, Rennes)

  Alignements locaux pour la reconnaissance de repliements des protéines par programmation linéaire en nombres entiers

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