Séminaires Bioinformatique

Lieu des séminaires :

INRIA Rennes - Bretagne - Atlantique

Gen2Bio

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Programme et informations

Journées Thématiques Bioinformatique

Dans le cadre de l'animation de Ouest-Genopole, le projet de binformatique (Symbiose) de l'Irisa organise des journées thématiques à destination des biologistes et informaticiens du Grand-Ouest.

Réseaux métaboliques

• Gilles Curien (Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale, CEA Grenoble)

  Modelling of an allosterically-controlled branched metabolic system

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• Vincent Lacroix (Genome Bioinformatics Research Group - CRG PRBB, Barcelona - Spain)

  Identification de motifs dans les réseaux métaboliques

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• Vincent Schachter (CNRS-Genoscope-Université d'Evry)

  Systematic refinement of a global metabolic model of Acinetobacter baylyi using gene essentialities

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Demie-Journée thématique : WorkFlows

• Marc Wessner (Inra, Jouy)

  Le projet BioWorkFlow

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• Franck Tanoh (myGrid Team, Manchester, UK)

  Une vision globale du projet myGrid

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• Philippe Picouet (LUSSI, ENST Bretagne)

  Projet BioSide: partager les compétences sur l'usage des ressources bioinformatiques

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Presentation de Marc Wessner

(bioworkflow_RENNES.pdf - 3.22 Mo)

Présentation de Franck Tanoh

(PlatformBioRennes.ppt - 13.64 Mo)

Presentation de Philippe Picouet

(20080416232157.pdf - 314.98 Ko)

Liens

Le site du projet bioworflow

Le serveur O3S

Demi-journée thématique : micro ARN

• Daniel Gautheret (Univ. Paris XI)

  Etre ou ne pas être un microRNA: l'existence précaire d'un régulateur capital

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• Stéphanie Jaubert et Denis Tagu (INRA, Rennes)

  Caractérisation des microARN chez un insecte phytophage : le puceron du pois Acyrthosiphon pisum

• Stephan Ossowski (Max Planck Institute for Developmental Biology, Tübingen)

  MicroRNA Target Search and Genome Wide Detection of Small RNAs

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D. Gautheret (diapos)

(gautheret.pdf - 548.71 Ko)

Séminaire du projet Symbiose

Séminaire de bioinformatique de l'Irisa. Le public est constitué du projet symbiose et de différents membres de l'Irisa.

Lieu des séminaires :

INRIA Rennes - Bretagne - Atlantique

Nicolas Brodu (Bunraku)

• Systèmes complexes et émergence

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Olivier Delgrange (Université de Mons-Hainaut)

• Analyse de séquences génétiques par compression : localisation optimale de régularités et comparaison d'une séquence relativement à d'autres

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Alban Mancheron (LIFL, Lille)

• Vers un nouvel Oracle : l'Oracle à transitions gardées

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(diapos)

(oracle-all.pdf - 4.25 Mo)

Jacques-Alexandre Sepulchre (INLN, Nice)

• Un effet de rétroaction dans les cascades de signalisation intracellulaire

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(diapos)

(Sepulchre080306.pdf - 3.19 Mo)

Nolwenn Le Meur (Inserm)

• Complexes protéiques et létalité synthétique

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Antoine Coulon (LIRIS, Lyon)

• Stochasticité de l'expression génique et dynamique des complexes de régulation

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Sergei Verlan (Univ. Paris XIII)

• Modélisation de la communication dirigée par la longueur dans le cadre du calcul moléculaire

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Diapos

(Verlan.pdf - 560.89 Ko)

B. Morgenstein (Univ. Gottingen)

Pierre Peterlongo (Symbiose)

• [REPORTE EN SEPTEMBRE] Tableau des suffixes

Mauro Valorani (Univ. Roma)

• A Framework for Adaptive Model Reduction in Chemical Kinetics

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B. Tallur (Symbiose)

• Test d'hypothèses multiples et leur application aux expériences microarray

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(diapos)

(SeminaireMultiplehypothesisTesting.pdf - 442.70 Ko)

Gabriel Infante-Lopez (Cordoba, Argentina)

• NLP Research at the NLP group at Córdoba

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Gwenael Kervizic (Inserm U613, Brest)

• Dynamical modeling of the cholesterol regulatory pathway

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Tessy Maliekal (National Centre for Biological Sciences, Bangalore)

• Notch and NF-кB modulate the effects of TGF-beta in cervical carcinoma cells

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Anne-Laure Abraham (Paris VI)

• Swelfe, un outil pour détecter les répétitions au niveau des gènes, des séquences protéiques et des structures tridimensionnelles

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Gilles Salbert (UMR 6026, université de Rennes 1)

• A la poursuite des régulations génétiques et épigénétiques de la transcription.

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Autres manifestations

Diverses manifestations portant sur la bioinformatique à Rennes et aux alentours

Seminaire SGI

Liens

details

Jacques Nicolas (Soutenance d'HDR)

• Syntaxe et Raisonnement sur les génomes

Goulven Kerbellec (Soutenance de thèse)

6èmes Rencontres autour de la plate-forme bio-informatique

Liens

Programme