Test d'hypothèses multiples et leur application aux expériences microarray

Une des questions importantes qui se pose dans les expériences microarray est celle d'identification des gènes "différentiellemnet exprimés", c'est à dire, les gènes qui ont une association "significative" avec une "variable réponse" (eg. temps de survie) ou une "co-variable" (eg. type de cellule) qui nous intéresse. Il s'agit, statistiquement, du problème de test d'hypothèse multiple: tester simultanément les hypothèses nulles de non-association entre les niveaux d'expression et les variables réponses (ou co-variables), pour chacun des gènes. Comme une expérience microarray mesure, typiquement, les niveaux d'expression de plusieurs milliers de gènes simultanément, on est confronté aux problèmes de multiplicité. Après avoir introduit les notions de tests multiples, nous aborderons les différentes méthodes, permettant de contrôler le taux de faux positifs ("False Discovery rate"), proposées dans la littérature.