Du gène à la fonction en glycobiologie marine: la chasse au trésor dans le génome de la flavobactérie marine Zobellia galactanivorans

Mirjam Czjzek (UPMC Univ. Paris 06, Station Biologique de Roscoff)

L'analyse du génome de la flavobactérie marine Zobellia galactanivorans (5,5 Mbp, 4738 gènes) a révélé un nombre
impressionnant de glycosides hydrolases (~120 gènes) ainsi que 70 sulfatases, impliqués dans la dégradation des
polysaccharides d'algues. La plupart de ces gènes ne sont pas répartis au hasard dans le génome et sont organisés en
groupes colinéaires suggérant l'existence d'opérons impliqués dans la dégradation de polysaccharides sulfatés
complexes. L'analyse bio-informatique du contexte génomique de certaines familles de protéines nous permet
d'identifier des candidats d'enzymes ayant de nouvelles activités ou spécificités de substrats. La conférence présentera
la caractérisation biochimique et structurale détaillée d'une nouvelle classe d'enzymes, découverte par cette stratégie.