Interprétation de données de séquençage de novo obtenues à grande échelle en protéomique d'organismes non séquencés
Ingrid Jacquemin (INRA, Nantes)
Mon projet de recherche vient en appui des projets de protéomique des compartiments subcellulaires initiés dans l'unité BIA (Biopolymères, Interactions, Assemblages) du département CEPIA. Les développements attendus à l'issu de ce projet devraient permettre d'approfondir l'interprétation des données de MS/MS issues de la plateforme RIO de spectrométrie de masse, en particulier dans un contexte d'augmentation des débits d'analyses. En effet, les améliorations des techniques dues d'une part à un appareillage de plus en plus précis dans les mesures de masses, d'autre part à la prise en charge de l'analyse de mélanges issus, par exemple, de protocoles associant chromatographie liquide et spectrométrie de masse, reste limitées par la capacité d'interprétation automatisée des résultats. Il s'agit ici de l'améliorer sensiblement, principalement dans le contexte de l'analyse des génomes non séquencés.