Frédérique Hubler ( UMR 6061 - CNRS- Université de Rennes 1)

Notre équipe travaille sur le développement d’un simulateur virtuel dédié à la réponse aux stress chez les bactéries. L’idée de ce projet émerge du paradoxe suivant: La biologie contemporaine permet de passer de la prédiction (Annotation des génomes) à l’analyse (transcriptome, protéome) mais il n’existe aucun outil intégrés permettant d’utiliser ces données pour réaliser des scénarios fidèles de biologie prédictive globale.
Nous avons fourni les efforts nécessaires au séquençage et à l’annotation du génome de Sinorhizobium meliloti pour finalement faire le constat que nous n’exploitions qu’une faible quantité de l'énorme connaissance ainsi générée.
Nous présenterons donc le projet « e-stress » et son premier module en cours de développement (OX)e-stress qui concerne la mise en œuvre de cette biologie prédictive globale, et exploitant l’ensemble des données des génomes, afin de prévoir le comportement des cellules bactériennes en réponse au stress oxydatif.