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Emmanuel Giudice (Equipe SDM UMR CNRS 6026)

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Jeudi 23 mars 2006 - 14h00 à 15h00 - Salle Minquiers

Contact : anne.siegel@irisa.fr

Simulation moléculaire de processus d'intérêt biologique

La plupart des macromolécules biologiques bougent et changent de conformation pour pouvoir exercer leurs fonctions. Malheureusement il n’existe pas de technique expérimentale capable d’observer le mouvement de ces macromolécules à l'échelle atomique. Il est donc nécessaire d'utiliser des techniques théoriques pour pouvoir étudier ces mouvements et mieux comprendre leurs implications sur la fonction des molécules. Mon exposé portera plus particulièrement sur l’intérêt d’une de ces technique : *La simulation de dynamique moléculaire*
En m’appuyant sur trois exemples d’applications pratiques : l’étude systématique de l’effet de séquence de l’ADN, l’étude de l’ouverture de paire de base de L’ADN et l’étude de la réplication d’un fragment endommagé d’ADN par la protéine DPO4, je vous montrerais que cette technique est non seulement capable d’apporter des informations importantes non seulement sur la dynamique des molécules à l'échelle moléculaire et atomique, mais également sur les forces internes qui agissent dans la ou entre les molécules.

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